夏洛克，妮洛，艾露克露，柯蒂妮娅这四人凭着出众的团队合作解决了许多事件成为了“福尔摩斯侦探学院”的人气星。学生和侦探都市横滨的市民们也憧憬的称她们为“少女福尔摩斯”。但是，在一个暴风雨的夜晚和宿敌“怪盗帝国”的战斗中“少女福尔摩斯”4人失去了Toys。事态突变，原本优秀的侦探“少女福尔摩斯”，变成了干什么都不行不行不行侦探了！无论如何都不能让Toys苏醒的“少女福尔摩斯”四人，因为担心事态的发展，学院的学生会长安利艾特，亮出了最后通牒！那是什么･･･？！